繼副首都法於七月三十一日公布後，二十六日召開了首次聯絡會議，由內閣府、總務省等負責副首都整備的相關部會實務官員參與，並公布了副首都指定時程。
預計在十月下旬公布政令，明確法規的施行日期及副首都的指定要件。法規施行後，預計在十一月公布關於副首都指定等相關的「基本方針」。
政令中將具體定義與東京圈同時遭受災害的可能性較低的地區。並明確指定要件，包括國家出先機關的設置地點、人口與經濟的集聚狀況，以及必要的行政體制等。
副首都將由符合政令要件的都道府縣提出申請後，由首相指定。根據內閣官房副首都整備等推進室的說法，都道府縣的申請預計在「基本方針」公布後才可能受理。副首都最快何時能被指定，目前尚未確定。
預計在明年十月制定包含副首都應承擔功能的綜合性「基本方針」。一旦被指定為副首都，將會制定各副首都的「整備方針」。