受颱風第六號的影響，東京都內的多條河川已發布了等級4的氾濫危險警報。
等級4是五個危險等級中的第二高，相當於地方政府發布避難指示的等級。在此區域內，所有居民都有必要從危險場所避難。
截至上午8點30分，發布等級4警報的河川包括流經杉並區的善福寺川、流經世田谷區及三鷹市等的野川與仙川、流經目黑區與品川區的目黑川，以及流經文京區等的神田川。
截至上午10點，東京都內已有八丈町、調布市、豐島區、品川區、杉並區發布了避難指示。世田谷區、文京區、町田市、大島町、千代田區則發布了高齡者等避難指示。
東京都政府於上午7點左右，針對23區及多摩地區發布了等級3大雨警報，並設置了水防本部。由建設局長久野健一郎擔任本部長，總括水害防止活動。